凡上帝所吩咐的，挪亚都依言办好了。洪水泛滥的时候，正是挪亚六百岁的那一年。挪亚和他的妻儿媳妇都进了方舟，躲避洪水。洁净的动物和不洁净的动物、飞鸟和地上的一切爬行生物，都像上帝所吩咐的一样，一对一对走进了挪亚的方舟。
这样过了七天，洪水就开始泛滥在地面了。就是在挪亚六百岁那一年的二月十七日那天，所有地下的水泉和洪流涌溢开来，天上的水源也敞开了。雨倾盆般的倒在地上，在四十昼夜之久。在那天，挪亚和他儿子闪、含、雅弗，还有挪亚的妻子和三个媳妇，都进了方舟。所有的野兽、牲畜和各样的地上爬行的生物、飞鸟都按着种类，一对一对地走进了挪亚的方舟。之后，上帝就为他们关上了门。
洪水在地上泛滥了四十天，水不断地往上涨，把方舟也漂了起来。洪水来势汹汹，淹盖大地，方舟却安稳地漂浮在水面上。水势愈来愈大，把地面各上的高山都淹没了。最后，水面比山岭还要高出二十二尺。世界上所有的生物，包括飞鸟、牲畜、野兽、爬行的动物，以及人类都死了。在陆地上所有用鼻孔呼吸的生灵全都死了。主就这样毁灭了地上所有的生物，包括人、动物、地上的爬虫，以及空中的飞鸟，只剩下挪亚和那些跟他同舟的人和动物了。洪水淹盖大地共达一百五十天之久。