在瑞典军队势如破竹的进攻态势下，斐迪南为扭转败局不得不重新启用华伦斯坦为统帅。华伦斯坦重整皇家军队和天主教联军之后，对军事部署作了适当调整。他首先率军将1631年进占布拉格的萨克森军队赶出波希米亚，接着实行战略性撤退把瑞典军队从维也纳和尼德兰南部吸引到萨克森，以集中优势兵力决战。1632年11月，双方在吕岑一地发生激战，这是30年战争中规模最大的一次战役。瑞典军队以微弱的优势获得了胜利，但杰出的军事统帅、富有远见的政治家古斯塔夫二世却在此役中阵亡。
吕岑战后稍事休整，瑞典军队在1633年4月又组织了由其发起，由法国资助，由德意志各新教诸侯参加的海尔布琅同盟，准备新的厮杀。德皇和天主教联盟方面的军队，不久却出现内讧。1634年1月斐迪南再次将华伦斯坦解职，军权交由皇太子（即后来的斐迪南三世）执掌。西班牙军队将协同皇家军队作战。1634年8-9月，交战双方在土瓦本的诺德林根会战，瑞军大败。此役决定了瑞典转向退却和暂时休战，建立不久的海尔布琅同盟也随之解体。而此时皇帝和天主教联盟方面的军队也是精疲力竭，没有多少战斗力了。1635年5月，萨克森新教诸侯与皇帝签署了布拉格和约，随后各新教诸侯也相继与皇帝议和。