黄昏时分，普将布吕歇尔元帅因应付法军三路进攻，左右频频调动，中路出现空档，法军实力最强的近卫军团乘机奋勇楔入，突入普军中央阵地，拦腰截断普军战线。普军首尾不能相顾，布吕歇尔元帅也因座骑中弹而坠马负伤。8.7万普军损失近3万，余皆溃逃。拿破仑见天黑夜暗，法军又疲惫，未连夜追击。待次晨天明，方令格鲁希元帅率步、骑兵3.5万人和大炮100门，向普军逃窜方向追击，但为时已晚。
6月17日清晨，英将威灵顿公爵得报普军溃败的噩耗后，深恐势孤被围，赶紧率军向北方布鲁塞尔方向撤退。拿破仑一面令纳伊率法军左翼部队追击英军，一面亲率右翼法军剩余部队，随纳伊部队跟进。正在这时，乌云四合，狂风大作，暴雨倾盆，道路皆被冲毁，田野化为泥塘，法军骑兵被迫暂停追击，英军得以从容退到布鲁塞尔大道中段小村庄滑铁卢附近。
滑铁卢北距比利时首都布鲁塞尔20余公里，地势由西北高地向东南倾斜。圣让山如一道长栓，横跨布鲁塞尔大道。两翼各有一列小山伸向前方，间距6公里，而且丛林密布，利于防守。英荷联军退到滑铁卢时，尚有步骑工炮6.8万人，大炮150门。威灵顿公爵决定利用滑铁卢的有利地形，阻截法军进攻，等待布吕歇尔元帅率普军回师，夹击法军。他把部队成梯次作纵深配置，步兵占领制高点，骑兵紧随其后，预备队置于圣让山之后，严阵以待。