1926年夏季，董贤珏介绍郭天民去广州报考黄埔军校。郭天民被编入黄埔第六期，受到极为严格的训练。
这时的黄埔军校内，国共两党的斗争日趋明显激烈。郭天民以自己的刚烈性格，在与孙文主义学会的斗争中每每打头阵，惹得右派分子非常恨他。大队长李亚芬是个正直的国民党人，私下多次劝郭天民“收敛”一些，免遭毒手。
就在蒋介石发动反革命政变的前夕——1927年3月，郭天民加入了中国共产党。上海四一二反革命政变之后，李亚芬找郭天民谈话，告诉他上海发生的事，并说：“你看看学校四周，机枪都架好了！你要是共产党，就赶快走。晚了，我也救不了你。”
没有组织的命令，一个共产党员怎么能擅离岗位呢！郭天民机智地回答：“谢谢大队长关心，我不是共产党。你知道的，我不过是脾气暴，嗓门大。要不是孙文主义学会那些人太霸道了，我不会和他们吵架。”在李亚芬的保护下，郭天民得以逃脱“清党”的屠刀。
1927年12月，郭天民随黄埔军校特务营参加了广州暴动，随队伍撤退到海丰县打游击。红2师和红4师既无给养又无弹药，且多数人不会讲广东话，无法在当地坚持斗争，只好“化兵为农”，分散到进步群众家里。