“三杨”除了在内政上积极进言献策之外，还参与到了大明朝的皇室纷争之中。宣德元年（公元1426年）八月，一直对皇位念念不忘的汉王朱高煦终于铤而走险起兵造反。朱瞻基起初计划派遣阳武侯薛禄率兵平叛，但是杨荣极力主张朱瞻基御驾亲征，从而达到“今出不意，以天威临之，事无不济”的效果。朱瞻基最终采取杨荣的建议，而此次平叛的结果也和杨荣预料的一样，朝廷军队一路旗开得胜，朱高炽被迫出城投降，叛乱顺利平定。
然而就在大军返程途中，户部侍郎陈山向朱瞻基举报“汉、赵二王实同心”，也就是说朱瞻基的三叔朱高燧也有不臣之心，并建议朱瞻基干脆趁机把朱高燧也一勺烩得了。对于陈山的这一建议，“三杨”之间发生了分歧，杨荣极力赞成陈山的建议，称“山言国之大计。”杨士奇则反，认为这种事情不能证实，也没有证据，如果就此把朱高燧抓起来，不合适啊。双发为此爆发了激励的争执，杨荣对着杨士奇厉声说道：“这是国家大事，怎么能磨磨唧唧，况且朱高燧与朱高煦勾结是经过锦衣卫证实的，有确切的证据。”
杨士奇则针锋相对地回应道：“锦衣卫拿出的那些东西能算证据吗，谁会信！”由此也可见当时的锦衣卫在大臣心中是多么声名狼藉。随后杨士奇又寻求蹇义、夏原吉两人的支持，但是两人也隐隐约约地站在杨荣一方。杨士奇只得又去劝说杨荣道：“太宗皇帝（朱棣）只有三个儿子，除去仁宗（朱高炽）外，皇帝只有两个亲叔叔，现在已经抓了一个证据确凿的朱高煦，如果再把朱高燧也抓起来，天下人会怎么看皇帝。”但是杨荣仍不肯退步。